Каменная колокольня Вышенского монастыря была построена в 1818 году в одном стиле с Казанским храмом. В среднем ярусе колокольни была устроена небольшая церковь во имя Живоначальной Троицы, освященная 8 января 1818 года. К 1914 году на колокольне было 14 колоколов. Подбор их был сделан весьма удачно, так что в большие праздничные дни звон бывал сильный, гармоничный и приятный.
В середине 70-х годов XX века колокольня была разобрана. Кирпичи пошли на постройку котельной, пристройки к лечебному корпусу, рентгенкабинета и пристройки (изолятора) к корпусу святителя Феофана. Сейчас на месте колокольни установлен крест.