В 1810 году Василий Федотович находился на богомолье в Киево-Печерской Лавре. Как беспаспортный был арестован за бродяжничество и осужден к ссылке в Сибирь на поселение. Путь до Иркутска продлился три года. Первые годы своего пребывания в Сибири Василий Надежин проживал при храмах, неся различные послушания, и обучал детей грамоте. В городе Кяхте он встретился со священником Аетием Разсохиным, по благословению которого в 1820 году тайно ушел в Чикойские горы для уединенной жизни, где предался богомыслию, молитве и подвигам поста и самоуничижения. В свободное время занимался переписыванием церковных книг, молитв для своих знакомых и благодетелей.
В 1824 году пустынника встретили охотники – и вскоре молва о благочестивом старце распространилась среди местного населения. Пустынь стали посещать как живущие неподалеку староверы, так и именитые граждане из Кяхты.
5 октября 1828 года по благословению епископа Иркутского Михаила настоятель Троицкого Селенгинского монастыря иеромонах Израиль постриг в монахи основателя Чикойского скита Василия Надежина с наречением имени Варлаам в честь св. Варлаама Печерского. Незадолго до пострига будущего подвижника игумения Казанского монастыря Елпидифора написала ему: «Знаю с начала вашего бытия, сколь много было вам терпения, но вы все претерпели ради Бога и угодников. Мужайся и крепися!.. Бог вас призывает к ангельскому образу. Надо благодарить Бога и радоваться сему подвигу. Но кто ж похвалится быть достойным сему игу? Никто. Господь призывает нас из небытия в бытие. Но вот – это совершенный есть подвиг».
В 1830 году святой был рукоположен во иеромонаха, в 1839 году возведен в сан игумена. Братия скита во главе с настоятелем проводили большую миссионерскую работу среди монгольского, бурятского и старообрядческого населения, просвещая их светом Христовой веры.
Преподобный скончался в 1846 году и был погребен с южной стороны алтаря придела в честь иконы «Всех скорбящих Радость» Иоанно-Предтеченского храма. В конце XIX века прославлен как местночтимый святой. В 1984 году прославлен для общецерковного почитания в Соборе Сибирских святых. В 2002 году среди руин Чикойского монастыря было определено место захоронения преподобного Варлаама и по благословению патриарха Алексия II 21 августа состоялось обретение его мощей, которые поместили в приделе Александра Невского в Казанском кафедральном соборе города Читы.
Икона преподобного Варлаама Чикойского с частицей мощей была передана в Успенский Вышенский монастырь митрополитом Читинским и Петровск-Забайкальским Владимиром 6 февраля 2016 года во время встречи крестного хода с вышенскими святынями.
